農(nóng)安古城始建于古夫余國，兩漢時曾是夫余國的都城。隋為高句麗夫余城。到唐朝是渤海國的夫余府。遼滅渤海后，改名為黃龍府，并設(shè)黃龍縣。關(guān)于黃龍府這個名字，有這樣一段傳說：公元926年（遼天顯元年），遼太祖耶律阿保機率兵攻打渤海國，他們先占領(lǐng)了夫余城。正月，又長驅(qū)直入攻打渤海王城忽汗城（今黑龍江省寧安市京城），渤海王投降。二月改渤海為東丹，改年號天顯，改忽汗城為天福城。此后遼太祖又回師夫余城，并在這里住下養(yǎng)病。七月，遼太祖病重。某夜有一顆巨星落于太祖殿前。次日天剛亮，夫余城上空便有一條黃龍盤旋繚繞，身長一里多，渾身光芒四射，金光耀眼。后來黃龍鉆進了太祖住的行宮，頓時紫氣遮天，黑煙蔽日，經(jīng)過一天時間才漸漸散去。不久太祖病故，終年55歲。從此遼將夫余府改為黃龍府。這段傳說當然不足為信，只是為了神化遼太祖，但黃龍府之名確是由此而來。
公元975年（遼保寧七年），黃龍府的衛(wèi)將燕頗反叛，殺了都監(jiān)張琚，遼派大軍平定了這起叛亂。戰(zhàn)火給古城造成了重創(chuàng)，隨后遼便放棄了黃龍府（農(nóng)安），將黃龍府南遷至今四平市的一面城。自此古城降到了很不重要的地位。45年后，遼圣宗為了加強其東北部的防御力量，再次把黃龍府遷回古城（農(nóng)安），為了避免重名，把一面城由黃龍府改為通州，把古城（農(nóng)安）仍稱黃龍府。領(lǐng)益州、安遠州、威州、清州、雍州、黃龍縣、遷民縣、永平縣。興宗時于東北境伊通河地置懷德縣，為祥州治（今農(nóng)安萬金塔鄉(xiāng)）。1037年（遼重熙六年），遼在黑龍江下游地區(qū)設(shè)節(jié)度使，統(tǒng)轄女真五國部，隸屬于黃龍府。此時是遼的極盛時期，當時黃龍府是各族人民雜居之地，人煙稠密，工商繁榮。據(jù)史料載：“凡聚會處，諸國人語言不能相通曉，則各為漢語以證方能辨之。”自黃龍府遷回之后，遼就對黃龍府加緊進行建設(shè)，使黃龍府成為“五京二府”七大重鎮(zhèn)之一。黃龍府雄踞在伊通河西岸的高地上，呈正方形，城垣周長3840米，四面除有大門外，在南、西、東三面還各有一個小門，四角各有一個高大的角樓。有名的農(nóng)安古塔就是在這個時期修建的。該塔用磚砌成，八角13層，高33米余，是中國東北地區(qū)最早修建的佛塔，至今已有千年，仍矗立在古城農(nóng)安。
關(guān)于造塔有許多傳說，其中一說：遼國欽天監(jiān)有一次夜觀天象，忽見有巨星從天而降，落在黃龍府附近。急奏圣宗：“黃龍府一帶恐怕要有土龍出世，應(yīng)立刻修一座塔壓住它。”圣宗聞聽大驚，立刻答應(yīng)，馬上命欽差隨欽天監(jiān)赴黃龍府造塔。欽差帶領(lǐng)大隊人馬，日夜兼程，走了七天七夜，來到黃龍府地界，當船行至祥州（今萬金塔鎮(zhèn)）時，發(fā)現(xiàn)土龍的頭就在這里，于是就決定把塔修在祥州。誰知塔剛修了半截，有一天夜里那個欽天監(jiān)又觀天象，忽然又大叫不好，說土龍知道要在祥州壓它，所以又掉頭跑回黃龍府了！于是干活的民工只好停下來，連夜趕到黃龍府去修塔。為了快些把塔修好，別讓土龍再跑掉，又征調(diào)了大批民工和車馬，日以繼夜地干。一晃過了3年3月零3天，塔終于修好了。這回土龍被壓在下面不能動了，圣宗松了一口氣，安心坐他的金鑾殿了。這個故事流傳至今，有人說這就是黃龍府地名的由來，也有人說，這就是俗名龍灣的由來。當然也有人解釋“龍灣”，是由于伊通河在此蜿蜒曲折，其形像龍一樣彎曲，故而得名。
“土龍”是被壓住了，可誰知到1115年（金收國元年），完顏阿骨打聚2500人誓師反遼，他的軍隊攻破黃龍府。而后阿骨打“命完顏婁室鎮(zhèn)守黃龍府”。金國建立以后，曾定都黃龍府，接著便不斷派兵進攻北宋政權(quán)，并于1126年（金天會四年）攻入開封，擄走徽、欽二帝。南宋初抗金英雄岳飛曾激勵部下，“直搗黃龍府與諸君痛飲耳”，即指此城。至今這段故事一直被傳為佳話。
當年完顏阿骨打在進攻黃龍府的途中，被松花江水所阻，附近又無船只，阿骨打急中生智，揮著馬鞭向江對岸一指，命軍隊沿著他馬鞭所指的方向涉水過江。結(jié)果人馬行至江心，水深剛及馬腹，大軍順利地過了江。等大軍過后他再派人測量剛才走的地方，竟深不可測。為了紀念這次渡江成功，1140年（金天眷三年）金下詔改黃龍府為濟州，又設(shè)利涉縣。后因與山東的濟州重名，且因黃龍府早有龍州之稱，故于1189年（金大定二十九年）改濟州為隆州，有時亦寫成龍州。1214年（金貞右二年），將州升為府，稱隆安府，為府治。元滅金后，1236年（蒙古窩闊臺汗八年）,仍稱黃龍府，廢利涉縣。1286年（元二十三年）,將府升為路，黃龍府先后為開元萬戶府、遼東路、開元路治所。后來開元路治所遷到咸平（今開原市），黃龍府古城便被廢棄。此后在戰(zhàn)火的硝煙中慢慢變成一片廢墟。1375年（明洪武八年）,屬遼東都司三萬衛(wèi)，后屬亦東河衛(wèi)，置龍安站。
明朝末年，這一帶變成了蒙古族的游牧之地。清初為郭爾羅斯前旗地，1791年（清乾隆五十六年）招墾。一直到1882年（清光緒八年），由于關(guān)內(nèi)流民來此耕種的日漸增多，清政府在這里設(shè)農(nóng)安分防照磨，屬長春廳。1889年（清光緒十五年），正式設(shè)農(nóng)安縣，農(nóng)安之名一直沿用到今天。取用“農(nóng)安”二字，為“隆安”、“龍安”的諧音。俗名“龍灣”，曾名農(nóng)安堡。
民國時期，1913年9月7日設(shè)扶農(nóng)鎮(zhèn)守使，使署駐農(nóng)安縣城，隸屬吉林省。1945年“八?一五”光復(fù)后，歸吉合行政區(qū)；12月被國民黨軍占領(lǐng)。1946年1月獲得解放，歸吉江區(qū)管轄；同年2月在前郭縣的老錢柜屯設(shè)立長農(nóng)縣，歸吉江區(qū)管轄；同年5月歸遼吉區(qū)第三區(qū)，9月改歸遼吉區(qū)第二專區(qū)。1949年4月，劃歸吉林省，撤銷長農(nóng)縣。1956年置農(nóng)安鎮(zhèn)，聚落呈正方形網(wǎng)格狀，今建成區(qū)面積30平方公里。
