內(nèi)設機構(gòu)：辦公室（黨委辦公室）、人事政工監(jiān)察科（黨委組織宣傳部）、綜合業(yè)務科、監(jiān)管科、查檢科、稽核查科

主要職責：承擔轄區(qū)內(nèi)（除霍爾果斯市、霍城縣、奎屯市、察布查爾錫伯自治縣）進出境運輸工具、貨物、物品、郵件及人員的征稅、監(jiān)管、緝私、出入境檢驗檢疫、統(tǒng)計等工作；承擔伊寧海關干部隊伍管理、基層黨建、準軍事化建設、宣傳思想文化等工作。根據(jù)總關黨委授權(quán)，承擔伊犁區(qū)域企業(yè)認證和稽核查作業(yè)的具體實施；承擔都拉塔海關、伊寧海關財務管理、綜合保障工作；承擔伊犁區(qū)域內(nèi)海關的后勤保障工作。完成烏魯木齊海關交辦的其他工作。