馬關縣疾病預防控制中心內(nèi)設10個科室，具體如下：

中心辦公室0876-7122536；

后勤科（財務科）0876-7124511；

預防接種門診0876-7120217；

衛(wèi)生檢驗科0876-7469555；

免疫規(guī)劃科0876-7120253；

結(jié)核病防治科0876-7127561；

艾滋病防治科0876-7123144；

地方病防治科0876-7120237；

處突辦公室0876-7120211；

慢性病管理科0876-7469558。